Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CbfbQ08024 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms