Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a1Q05722 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a1Q05722 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a1Q05722 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 900.7 ms