Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlh1Q02576 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nhlh1Q02576 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms