Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VcpQ01853 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VcpQ01853 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms