Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax8Q00288 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms