Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CiitaP79621 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiitaP79621 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiitaP79621 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms