Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig1P70193 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrig1P70193 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms