Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd2P62317 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd2P62317 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd2P62317 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms