Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpd1P62315 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms