Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnrpfP62307 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpfP62307 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpfP62307 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms