Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SnrpeP62305 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpeP62305 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 475.6 ms