Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhbdl3P58873 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rhbdl3P58873 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdl3P58873 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms