Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtnsP57757 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtnsP57757 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtnsP57757 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtnsP57757 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtnsP57757 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms