Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c40P56657 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c40P56657 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp2c40P56657 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms