Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GemP55041 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GemP55041 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GemP55041 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GemP55041 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GemP55041 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GemP55041 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GemP55041 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GemP55041 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GemP55041 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GemP55041 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GemP55041 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GemP55041 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GemP55041 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GemP55041 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GemP55041 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GemP55041 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GemP55041 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GemP55041 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GemP55041 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GemP55041 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GemP55041 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GemP55041 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms