Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad23aP54726 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms