Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ube2e3P52483 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms