Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XpcP51612 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XpcP51612 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XpcP51612 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XpcP51612 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XpcP51612 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XpcP51612 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XpcP51612 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XpcP51612 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XpcP51612 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XpcP51612 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XpcP51612 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XpcP51612 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XpcP51612 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XpcP51612 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XpcP51612 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XpcP51612 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XpcP51612 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XpcP51612 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XpcP51612 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XpcP51612 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
XpcP51612 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XpcP51612 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XpcP51612 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XpcP51612 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XpcP51612 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XpcP51612 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms