Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HpdP49429 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HpdP49429 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpdP49429 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HpdP49429 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HpdP49429 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HpdP49429 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpdP49429 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpdP49429 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpdP49429 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpdP49429 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpdP49429 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpdP49429 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpdP49429 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpdP49429 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpdP49429 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpdP49429 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpdP49429 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpdP49429 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms