Protein–RNA interactions for Protein: P48744

Ndp, Norrin, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdpP48744 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdpP48744 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdpP48744 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NdpP48744 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdpP48744 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdpP48744 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdpP48744 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdpP48744 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NdpP48744 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdpP48744 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms