Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl13P47963 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms