Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv1P41164 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv1P41164 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms