Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Grin2aP35436 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2aP35436 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2aP35436 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms