Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f3P31361 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou3f3P31361 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou3f3P31361 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms