Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprmP28828 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprmP28828 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprmP28828 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprmP28828 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprmP28828 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprmP28828 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprmP28828 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprmP28828 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprmP28828 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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