Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vav1P27870 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vav1P27870 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms