Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RarbP22605 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RarbP22605 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RarbP22605 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RarbP22605 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RarbP22605 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RarbP22605 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RarbP22605 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RarbP22605 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RarbP22605 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RarbP22605 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RarbP22605 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RarbP22605 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RarbP22605 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RarbP22605 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RarbP22605 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RarbP22605 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RarbP22605 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RarbP22605 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RarbP22605 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms