Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcna1P16388 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms