Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myod1P10085 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myod1P10085 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myod1P10085 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms