Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Schip1P0DPB4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Schip1P0DPB4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms