Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06321 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06321 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06321 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06321 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06321 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06321 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06321 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06321 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06321 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06321 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06321 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06321 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06321 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06321 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06321 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06321 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms