Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms