Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01648 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01648 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01648 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01648 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01648 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01648 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01648 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P01648 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P01648 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01648 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01648 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01648 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01648 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01648 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01648 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01648 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01648 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01648 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01648 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01648 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01648 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01648 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01648 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01648 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01648 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
P01648 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01648 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01648 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01648 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01648 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01648 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01648 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01648 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms