Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sap30O88574 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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