Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt1O88346 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms