Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtogO55225 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtogO55225 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtogO55225 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtogO55225 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtogO55225 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtogO55225 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtogO55225 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtogO55225 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtogO55225 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.3 ms