Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a2O54833 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a2O54833 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms