Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NudcO35685 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NudcO35685 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NudcO35685 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NudcO35685 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NudcO35685 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NudcO35685 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NudcO35685 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NudcO35685 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NudcO35685 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NudcO35685 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NudcO35685 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NudcO35685 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NudcO35685 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NudcO35685 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NudcO35685 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NudcO35685 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NudcO35685 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NudcO35685 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NudcO35685 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NudcO35685 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NudcO35685 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NudcO35685 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NudcO35685 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms