Protein–RNA interactions for Protein: O35671

Itgb1bp1, Integrin beta-1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp1O35671 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb1bp1O35671 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1bp1O35671 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms