Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms