Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrcpO35427 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrcpO35427 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CrcpO35427 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrcpO35427 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms