Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Abcc1O35379 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Abcc1O35379 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Abcc1O35379 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Abcc1O35379 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms