Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcns1O35173 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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