Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6594J3QM43 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm6594J3QM43 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm6594J3QM43 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm6594J3QM43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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