Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933406M09RikG3XA12 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933406M09RikG3XA12 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms