Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ercc6F8VPZ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ercc6F8VPZ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms