Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110082J24RikF6Z6Z2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110082J24RikF6Z6Z2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110082J24RikF6Z6Z2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms