Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm10563F6WIE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10563F6WIE4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms