Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1bF6V0H0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1bF6V0H0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms