Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrdnE9Q9K5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms